התייחסותו של שר המדע ויו"ר מפלגת "הבית היהודי", הרב דניאל הרשקוביץ, להמשך תוכנית ההקפאה - הצליחה לעורר מחדש את שאלת יחסי האחדות שבין "הבית היהודי" ל"איחוד הלאומי", חרף הצהרתם המשותפת לפני מספר חודשים בדבר ריצה משותפת אל הבחירות הבאות לכנסת.
כזכור, אמש, בראיון לרדיו "קול חי", הציג השר הרשקוביץ עמדה פרגמטית, לפיה יש לשקול בחיוב את המשך הקפאת הבנייה בהתיישבות בתמורה להבטחה מארצות הברית כי לא תפעיל לחץ נוסף על ישראל. "שאלתי את מועצת יש"ע - אם נניח שאובמה ידרוש הקפאה של חודשיים ובתמורה יבטיח שלאחר מכן לא ילחץ ולא יתנגד לבנייה בכל חלקי ארץ ישראל, הם אמרו "אנחנו קופצים על זה"", אמר.
במועצת יש"ע מיהרו להסביר אתמול כי "הדברים משוללים כל יסוד והפוכים מן המציאות" וכי במועצה "מצרים על ההתבטאות של השר הרשקוביץ שפוגעת במאבק נגד חידוש ההקפאה, מאבק ששר המדע צריך להיות ממנהיגיו".
ח"כ מיכאל בן-ארי הגיב בחומרה לדבריו של השר הרשקוביץ, באומרו כי "להיטותו של הרשקוביץ לדבוק בכסא הממשלה, מעבירה אותו על דעתו". לדברי ח"כ בן-ארי, "במפד"ל כמו במפד"ל, ברור שמי שמכשיר הקפאה ליום, לא יתנגד גם לגירוש יהודים. יוזמת הרשקוביץ להמשך ההקפאה "רק לחודש" נותנת לנתניהו את הלגיטמציה להמשיך להיכנע".
גם ח"כ אריה אלדד ("האיחוד הלאומי"), תקף את הרשקוביץ על דבריו. "מי צריך את השמאל של מפלגת העבודה, אם זו עמדתו של ראש המפד"ל?", תהה ח"כ אלדד, "הרשקוביץ ויתר עקרונית על זכותם של יהודים לבנות בכל עת בארץ ישראל, גם אם יסביר עד מחר שהתכוון לעיסקה שהאמריקאים לא יקבלו". לדבריו, "אם לא יחזור בו - הוא יאבד את עולמו בשעה אחת".
בעקבות התגובות הבהיר השר הרשקוביץ כי דבריו הוצאו מהקשרם. בתגובה לכיפה הסביר השר: "צר לי שלא סיפקתי לרדיו "קול חי" את הכותרת שחיפש. אני מתנגד נחרצות לכל המשך הקפאה ולמחוות היפוטתיות".